Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TIMMDC1Q9NPL8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMMDC1Q9NPL8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMMDC1Q9NPL8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms