Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1549Q9HCM3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms