Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX8Q9HC52 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms