Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LY9Q9HBG7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms