Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ELL3Q9HB65 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELL3Q9HB65 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms