Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms