Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms