Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms