Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF4Q9H2L5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms