Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIL1Q9H173 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIL1Q9H173 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SIL1Q9H173 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIL1Q9H173 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIL1Q9H173 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIL1Q9H173 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIL1Q9H173 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SIL1Q9H173 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SIL1Q9H173 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms