Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C1

ZMYND12, Zinc finger MYND domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND12Q9H0C1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ZMYND12Q9H0C1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZMYND12Q9H0C1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZMYND12Q9H0C1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZMYND12Q9H0C1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZMYND12Q9H0C1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZMYND12Q9H0C1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZMYND12Q9H0C1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZMYND12Q9H0C1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZMYND12Q9H0C1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZMYND12Q9H0C1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms