Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NBPF3Q9H094 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms