Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM5Q9C035 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms