Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMES1Q9C002 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms