Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
NLRP1Q9C000 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NLRP1Q9C000 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NLRP1Q9C000 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NLRP1Q9C000 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms