Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BARHL1Q9BZE3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms