Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NIFKQ9BYG3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NIFKQ9BYG3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms