Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC8Q9BY41 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC8Q9BY41 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms