Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SCAPERQ9BY12 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms