Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms