Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR4Q9BXB1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR4Q9BXB1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms