Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOL6Q9BWW8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms