Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW66

CINP, Cyclin-dependent kinase 2-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CINPQ9BW66 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CINPQ9BW66 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CINPQ9BW66 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms