Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM106CQ9BVX2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM106CQ9BVX2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms