Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC2P3Q9BVR0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC2P3Q9BVR0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms