Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN3Q9BTN0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRFN3Q9BTN0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms