Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 542.9 ms