Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LARP6Q9BRS8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms