Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf43Q9BQ61 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C19orf43Q9BQ61 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C19orf43Q9BQ61 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C19orf43Q9BQ61 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C19orf43Q9BQ61 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf43Q9BQ61 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf43Q9BQ61 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf43Q9BQ61 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf43Q9BQ61 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf43Q9BQ61 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms