Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOL4Q9BPW4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOL4Q9BPW4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOL4Q9BPW4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOL4Q9BPW4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOL4Q9BPW4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOL4Q9BPW4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOL4Q9BPW4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOL4Q9BPW4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOL4Q9BPW4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
APOL4Q9BPW4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL4Q9BPW4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL4Q9BPW4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL4Q9BPW4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL4Q9BPW4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL4Q9BPW4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL4Q9BPW4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL4Q9BPW4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL4Q9BPW4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL4Q9BPW4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL4Q9BPW4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 564.3 ms