Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRX2Q99811 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms