Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS8Q99627 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms