Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MMP19Q99542 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms