Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms