Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC85AQ96PX6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms