Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPG4P5Q96PW8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG4P5Q96PW8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms