Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCEEQ96PE7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms