Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP3Q96P47 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP3Q96P47 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms