Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD27Q96NW4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD27Q96NW4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms