Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
JSRP1Q96MG2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms