Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00479Q96M42 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms