Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC74BQ96LY2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms