Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PRAC1Q96KF2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms