Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A4AQ96JQ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms