Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC136Q96JN2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms