Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRIG1Q96JA1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms