Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A3Q96HJ5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A3Q96HJ5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms