Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms