Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML4Q96GE6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CALML4Q96GE6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms