Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO1Q96FE5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO1Q96FE5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO1Q96FE5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO1Q96FE5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO1Q96FE5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO1Q96FE5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO1Q96FE5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINGO1Q96FE5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINGO1Q96FE5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINGO1Q96FE5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINGO1Q96FE5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINGO1Q96FE5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINGO1Q96FE5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINGO1Q96FE5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms